自然资源部职业技能鉴定指导中心为公益二类事业单位。2007年1月，经中编办批准，组建国家测绘局职业技能鉴定指导中心。2012年8 月，更名为国家测绘地理信息局职业技能鉴定指导中心。2013年9月，原国家测绘地理信息局党组研究决定，在中心加挂“国家测绘地理信息局党校、国家测绘地理信息局管理干部学院”牌子。2018年9月，更名为自然资源部职业技能鉴定指导中心。