江门市疾病预防控制中心的前身是创建于1953年的江门市卫生防疫站，从原来的一个技术力量薄弱、设备简陋的小站，在实践中不断探索，逐步发展壮大。1997年通过评审，被卫生部命名为“地市级一等卫生防疫站”。