三门县气象局始建于196８年，前身称三门县气象站，1990年12月改称三门县气象局。三门县气象局的机构规格为正科级全额拨款事业单位，内设4个科室：办公室、气象台、地面探测站（2001年气象站搬迁至马加山）、雷电管理办公室。实行上级气象主管机构与本级人民政府双重领导的管理体制，根据授权，承担本行政区域内气象工作的政府行政管理职能，依法履行气象主管机构的各项职责。目前气象局有干部职工19人，其中本科以上11人，大专以上19人。