根据卫生部《关于卫生监督体制改革实施意见》的统一要求，经西安市政府、市编委批准，西安市疾病预防控制中心是在西安市卫生防疫站、西安市地方病防治所、西安市结核病防治所、西安市性病监测中心的基础上组建，于2002年9月30日正式挂牌成立，当年11月4日正式运行。