北京大学口腔医学院创建于1941年。2002年，北京大学口腔医学院口腔临床医学被教育部正式批准为全国高等学校重点学科。口腔医学学科群被列为北京大学医学部“211工程”“十五”重点建设的十大学科群之一，总体水平在国内处于领先地位，有些已达国际先进水平。