沪西校区原为上海铁道大学(本部）。1995年5月上海铁道学院与上海铁道医学院合并成立上海铁道大学，校本部设在原上海铁道学院。2000年4月同济大学与上海铁道大学合并，成立新的同济大学，原上海铁道大学(本部）成为同济大学沪西校区。2000年7月设立沪西校区管理委员会，8月设立中共同济大学沪西校区工作委员会(简称党工委）。